Maintenant que Slugterra est débarrassée de Blakk, tous les méchants de moindre importance réapparaissent au grand jour, comme Chef Ember qui s'empare du centre commercial. Cependant, le véritable danger se situe à l'Est où un sorcier, capable de posséder l'esprit des lanceurs et de fabriquer des goules, menace d'envahir les 99 cavernes.
L’empereur Kuzco pensait tout avoir : un peuple dévoué, une garde-robe de tenues chics et son groove inébranlable. Mais sa vie est bouleversée lorsqu’il est transformé en lama par sa conseillère sournoise Yzma et son acolyte Kronk. À présent, le souverain doit s’associer à un paysan sympathique nommé Pacha. Une folle aventure s’ensuit.
En Angleterre, au XVIe siècle, deux garçons que tout oppose se rencontrent par hasard : Tom Canty, enfant pauvre des rues de Londres et Edward, jeune héritier du roi Henry VIII. Leur rencontre a lieu au Château de Westminster où Edward a aperçu Tom le regarder derrière les grilles. Notant immédiatement leur incroyable ressemblance physique (ils ressemblent à des frères jumeaux), ils ont l’idée de s’échanger leur identité. En effet, Tom rêve de manger à sa faim et d’être bien traité (son père le bat pour le forcer à mendier) tandis qu’Edward rêve de liberté et d’échapper à l’étiquette de la cour d’Angleterre.
